Mekong Smart City có vị trí tọa lạc tại thị xã Tân Châu và huyện Hồng Ngự, thuộc hai tỉnh An Giang và Đồng Tháp. Dự án nằm phía đầu nguồn sông Mê Kông, nơi đây còn là cửa ngõ giao thương của Việt Nam – Campuchia và của khu vực vùng Đồng bằng sông Cửu Long.
